行政办公室
负责行政事务和后勤管理工作，包括公关、文秘、档案、内务管理及后勤管理工作；承办机构编制、人事劳动等方面的具体工作。包括协助局领导组织、协调机关日常工作，监督执行局机关各项议事规则和工作制度；负责保护区重要政务信息工作,负责发文的审核、送签、校印、监印和发送文书管理工作；负责来往文件的收发、传递工作；负责局机关的档案管理，指导局下属单位的档案工作；负责受理重要来信来访，督促、协调管理局和有关下属单位的信访工作；负责项目材料的上报和组织实施；承担管理局工作人员日常思想政治工作。
计划财务科
严格遵守国家及上级有关部门财经制度、法律、规章、制度等。坚持原则、廉洁奉公、遵守职业道德。完成管理局日常财务管理和有关证照的年检（审）等工作。严格执行财务计划或预算，根据国家统一的会计制度、《会计基础工作规范》的有关规定以及财务收支计划或预算、合同等，对原始凭证的真实性、合法性、有效性进行审核。按国家统一会计制度的要求审核原始单据、填制记账凭证并登记帐薄。必须严格按《现金管理暂行条例》、《支付结算办法》、《票据法》等有关规定进行货币收付业务的管理和核算。熟悉国家有关法律、法规、规章、制度，提供真实完整的会计资料，建立健全财务档案。严格实行财务报账和领导审批制度，确保所经管的财产物资安全、完整。
保护管理科
制定保护区资源保护管理计划，对管理站、管护点进行业务工作指导、监督和检查；负责保护区内生物资源保护和管理、植被恢复、森林病虫害防治等工作；协助相关单位开展保护区内的本底资源调查及其它工作。
科技宣教科
负责保护区资源调查、资源动态变化监测、珍稀野生植物培育、野生动物的救护及相关科学研究；负责建设并经营管理植物种质资源收集；负责宣传林业政策、法规、条例，进行职工技术培训和社区群众的宣传教育。
